تفاوت اساسی این دو مدل ، در 4 قسمت هست  :
1 - تمام خارن های به کار رفته در مدل EP43-DS3L از نوع Solid ساخت ژاپن هستند ، این خازن ها به دلیل جریان نشتی بسیار کمتر طول عمری حدودا 2 برابرخازن های الکترولیتی دارند . همچنین تحمل بیشتری در برابر حرارت دارند . روی هم رفته ، برد هایی که از این خارن ها درشون به کار رفته معمولا خنک تر از برد های معمولی فعالیت می کنند . 
2 - مدل EP43-DS3L  دارای یک کانکتور optical S/PDIF Out می باشد . 
3 - هیتسینک خنک کننده ای که در مدل EP43-DS3L برای چیپ NB به کار رفته ، بزرگتر می باشد . در نتیجه توانایی دفع حرارت بیشتری را خواهد داشت . 
4 - احتمال می دم امکانات BIOS مدل EP43-DS3L جهت اورکلاکینگ ، کمی بیشتر از مدل EP43-S3L باشه . 
در بقیه موارد ، این 2 مادربورد به شدت مشخصات مشابهی دارند . 
از نظر شخصی بنده ، مدل EP43-DS3L ارزش 10 هزار تومان اختلاف قیمت بیشتر با مدل EP43-S3L رو داره ، انتخاب نهایی با شماست .