کشف اسرار کتابی از سید روح الله خمینی است که ظاهراً در اواخر دهه 1320 و پس از پایان حکومت رضا شاه پهلوی تألیف شده‌است. این کتاب ردیه‌ای است بر جزوه‌ای که در سال 1332 در نقدِ عقاید شیعهٔ امامیه، در هفته نامه پرچم ، از علی اکبر حکمی زاده و با عنوانِ اسرار هزار ساله به چاپ رسیده بود. در این کتاب، آیت الله روح‌الله خمینی بیان نموده‌است که امام دوازدهم مسؤولیت حفظ امت را به مجتهدان واگذار کرده است؛ هر چند مجتهدان باید خود را از دولت دور نگه دارند و آن را چون شر لازم قلمداد و تحمل نمایند. آیت الله خمینی در کشف‌الاسرار اقتدار سیاسی عالی برای علما در نظر می‌گیرد، اما تنها هنگامی می‌بایست آن را به کار بندند که حکومت آشکارا به حریم شریعت تجاوز می‌کند.آیت الله خمینی در این کتاب می‌نویسد:
ما ذکر کردیم که هیچ فقیهی نگفته تا کنون و در کتابی هم ننوشته که ما شاه هستیم. یا نگفته که سلطنت حق ماست. آری آن طور که ما بیان کردیم، اگر سلطنت و حکومتی تشکیل شود، هر خردمندی تصدیق می‌کند که آن خوب است و مطابق با مصالح کشور و مردم است. البته بهترین تشکیلات آن است که بر اساس احکام خدا و عدل الهی باشد، لکن اکنون که آن را از آن‌ها نمی‌پذیرند، این‌ها هم با این هیچ‌گاه مخالفت نکرده و نمی‌خواسته‌اند که اساس حکومت را بر هم بزنند
محتوای مخفی: معرفی کتاب
