تیمی متشکل از زیستشناسان، فیزیکدانان و پزشکان از دانشگاههای مختلف آمریکا با طراحی مدل اتم به اتم پوسته ویروس ایدز، امیدوارند که این مدل بتواند به توسعه داروهای جدید با قابلیت هدف قرار دادن کپسید کمک کند.به گزارش سرویس فناوری خبرگزاری دانشجویان ایران (ایسنا)، پوسته ای که ویروس HIV مواد ژنتیکی را درون آن نگه می دارد، جزئیات بیسابقه ای از این ویروس در اختیار محققان قرار میدهد.اسید نوکلئیک ویروس درون یک پوسته پروتئینی به نام کپسید (capsid) محصور شده است؛ کپسید ویروس نقص سیستم ایمنی بدن انسان بطور همزمان یک پوشش و یک درپشتی باز محسوب می شود که از مواد ژنتیکی درون ویروس محافظت میکند.در زمان ورود ویروس به سلول بدن انسان، کپسید به شیوه ای منظم جدا شده و امکان تصاحب سلول توسط ویروس را فراهم می کند.کپسید در برابر داروهای خاص بسیار آسیب پذیر است و محققان با کمک این ویژگی بدنبال توسعه درمانهای بالقوه هستند؛ اما هنوز داروی ضد ایدز با قابلیت هدف قرار دادن کپسید تولید نشده است.«کلاوس شولتن» از فیزیکدانان دانشگاه ایلینویز تأکید میکند: زمان باز شدن کپسید برای درجه بیماریزایی ویروس ضروری است که احتمالا میتواند بهترین راه حل برای تداخل و مقابله با عفونت HIV باشد.محققان برای نخستین بار موفق به طراحی مدلی از ساختار کپسید ویروس HIV در ساختار اتمی با استفاده از یک ابر رایانه پرقدرت شدند که نحوه شکل دهی پروتئینها بر سطح کپسید را با جزئیات دقیق نشان میدهد.شبیهسازی تمامی 64 میلیون اتم در کپسید با کمک ابر رایانه بلو واترز (Blue Waters) دانشگاه ایلینویز با قدرت محاسباتی یک پتافلاپ انجام شد.محققان در تحقیقات خود دریافتند، کپسید متشکل از 216 پروتئین به شکل شش ضلعی منظم در کنار یکدیگر مانند لانه زنبور است؛ در همین حال 12 پروتئین استراتژیک پنج ضلعی در این پوسته وجود دارد که با ایجاد گوشه های تیز، یک مخروط باریک تشکیل می دهد.برای کنترل کردن مدل طراحی شده، محققان نتایج خود را با داده های بدست آمده در خصوص کپسید ویروس HIV از جمله شکل متمایز کپسید مقایسه کردند که این مدل کاملا متناسب با داده های موجود است.نتایج این دستاورد در مجله Nature منتشر شده است.
مدل اتمی کپسید ایدز متشکل از 216 پروتئین شش ضلعی و 12 پروتئین پنج ضلعی (زرد)
isna.ir